截至2019年,全区现有各级各类学校99所,其中公办学校56所,含完中1所,九年一贯制学校5所,初中7所,小学18所 (含3个教学点),幼儿园23所(其中省一类园1所),省级示范中等职业学校1所,教师进修学校1所;民办学校43所,含初中1所(滁州外国语学校附属苏滁实验学校)、十二年一贯制学校2所(新锐私立学校、海亮学校)、九年一贯制学校1所(碧桂园外国语学校)、完中2所(十一中、新英中学)、高中1所(博世高中)、小学3所(十一中附小、新锐小学、阳光双语学校)、幼儿园33所。
全区在校生总人数54274人,其中:小学生23730人、初中生10221人、普通高中生3192人,中等职业学校学生3460人,幼儿13671人。教职工4182人,其中专任教师3173人。
南谯区义务教育普及程度和教育质量指标水平超过省颁标准, “两基”工作位于省、市前列。乌衣中学、章广初中、第二幼儿园争创市级示范高中、市农村特色初中、市一类幼儿园获得成功,职业教育连续三年获全市第一名。4年共投入2212.95万元用于中小学危房改造和校舍建设,新建校舍62517平方米、消除危房41601平方米,顺利完成中小学校一期危改任务,受到省危改办表彰。